关于r:geom_raster()的相对性能

Relative performance of geom_raster()

我有一个R / ggplot2用例,似乎需要geom_raster:一个在x,y位置带有z值的常规笛卡尔网格。我一直在使用geom_tile,并且期望从切换到geom_raster可以提高性能。但是我似乎没有看到...

这是一个玩具示例(但大小合适),使用base图形:

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n <- m <- 200
x <- 1:n
y <- 1:m
f <- function(x, y) 10 * sin(x / n) * cos(y / m)
z <- outer(x, y, f)
system.time(image(z))

   user  system elapsed
  0.998   0.007   1.023

这里是ggplot2

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obs <- expand.grid(x=x, y=y)
obs$z <- as.numeric(as.list(z))
require(ggplot2)
p <- ggplot(obs, aes(x=x, y=y, fill=z))
system.time(show(p + geom_tile()))

   user  system elapsed
  7.328   0.891   8.187

require(ggExtra)
system.time(show(p + geom_raster()))

   user  system elapsed
  7.000   0.637   7.799

因此,收益适中,但与我的预期相去甚远。我做错了吗?提前非常感谢!


您应该使用最新版本ggplot2(当前为开发版本)中的geom_raster,而不是ggExtra中的越野车原型(此软件包现已弃用,顺便说一句)。

这样做,我得到了更好的结果,即4.705与1.416(已过去)。很大的进步。

编辑:事实证明,ggplot2中的?geom_raster在我的系统上已经提供了更好的基准。

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benchplot(base + geom_raster())
       step user.self sys.self elapsed
1 construct     0.006    0.004   0.010
2     build     0.887    0.212   1.109
3    render     0.449    0.119   0.584
4      draw     0.108    0.005   0.141
5     TOTAL     1.450    0.340   1.844
> benchplot(base + geom_tile())
       step user.self sys.self elapsed
1 construct     0.016    0.005   0.026
2     build     1.031    0.329   1.365
3    render     1.021    0.297   1.318
4      draw     0.987    0.041   1.040
5     TOTAL     3.055    0.672   3.749