关于python:如何在matplotlib中使用imshow将NaN值绘制为特殊颜色?

How can I plot NaN values as a special color with imshow in matplotlib?

我正在尝试在matplotlib中使用imshow将数据绘制为热图,但其中一些值为NaN。 我希望将NaN渲染为在颜色图中找不到的特殊颜色。

例:

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import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
f = plt.figure()
ax = f.add_subplot(111)
a = np.arange(25).reshape((5,5)).astype(float)
a[3,:] = np.nan
ax.imshow(a, interpolation='nearest')
f.canvas.draw()

生成的图像出乎意料地是全蓝色(喷射彩色图中的最低颜色)。 但是,如果我这样作图:

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ax.imshow(a, interpolation='nearest', vmin=0, vmax=24)

-然后我得到了更好的结果,但是NaN值的绘制颜色与vmin相同...是否可以通过一种优美的方式将NaN设置为使用特殊颜色绘制(例如:灰色或透明)?


嗯,看来我可以使用蒙版数组来做到这一点:

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masked_array = np.ma.array (a, mask=np.isnan(a))
cmap = matplotlib.cm.jet
cmap.set_bad('white',1.)
ax.imshow(masked_array, interpolation='nearest', cmap=cmap)

这应该足够了,尽管我仍然愿意提出建议。 :]


对于较新版本的Matplotlib,不再需要使用掩码数组。

例如,让我们生成一个数组,其中每个第7个值都是NaN:

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arr = np.arange(100, dtype=float).reshape(10, 10)
arr[~(arr % 7).astype(bool)] = np.nan

我们可以修改当前的颜色图,并使用以下几行来绘制数组:

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current_cmap = matplotlib.cm.get_cmap()
current_cmap.set_bad(color='red')
plt.imshow(arr)

plot result