关于r:折叠/连接/聚集一列为每个组中单个逗号分隔的字符串

Collapse / concatenate / aggregate a column to a single comma separated string within each group

我想根据两个分组变量在数据框中汇总一列,并用逗号分隔各个值。

以下是一些数据:

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data <- data.frame(A = c(rep(111, 3), rep(222, 3)), B = rep(1:2, 3), C = c(5:10))
data
#     A B  C
# 1 111 1  5
# 2 111 2  6
# 3 111 1  7
# 4 222 2  8
# 5 222 1  9
# 6 222 2 10

" A"和" B"是分组变量," C"是我要折叠成逗号分隔的character字符串的变量。我试过了:

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library(plyr)
ddply(data, .(A,B), summarise, test = list(C))

    A B  test
1 111 1  5, 7
2 111 2     6
3 222 1     9
4 222 2 8, 10

但是当我尝试将测试列转换为character时,它变成这样:

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ddply(data, .(A,B), summarise, test = as.character(list(C)))
#     A B     test
# 1 111 1  c(5, 7)
# 2 111 2        6
# 3 222 1        9
# 4 222 2 c(8, 10)

如何保持character格式并用逗号分隔?例如,第1行应仅为"5,7",而不应为c(5,7)。


以下是使用toString的一些选项,该功能使用逗号和空格将字符串向量连接起来以分隔各个组成部分。如果不想使用逗号,则可以将paste()collapse参数一起使用。

data.table

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# alternative using data.table
library(data.table)
as.data.table(data)[, toString(C), by = list(A, B)]

aggregate这不使用任何软件包:

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# alternative using aggregate from the stats package in the core of R
aggregate(C ~., data, toString)

sqldf

这是使用sqldf包的SQL函数group_concat的替代方法:

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library(sqldf)
sqldf("select A, B, group_concat(C) C from data group by A, B", method ="raw")

dplyr A dplyr替代:

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library(dplyr)
data %>%
  group_by(A, B) %>%
  summarise(test = toString(C)) %>%
  ungroup()

plyr

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# plyr
library(plyr)
ddply(data, .(A,B), summarize, C = toString(C))


这是stringr / tidyverse解决方案:

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library(tidyverse)
library(stringr)

data <- data.frame(A = c(rep(111, 3), rep(222, 3)), B = rep(1:2, 3), C = c(5:10))


data %>%
 group_by(A, B) %>%
 summarize(text = str_c(C, collapse =","))

# A tibble: 4 x 3
# Groups:   A [2]
      A     B test
  <dbl> <int> <chr>
1   111     1 5, 7
2   111     2 6    
3   222     1 9    
4   222     2 8, 10


更改放置as.character

的位置

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> out <- ddply(data, .(A, B), summarise, test = list(as.character(C)))
> str(out)
'data.frame':   4 obs. of  3 variables:
 $ A   : num  111 111 222 222
 $ B   : int  1 2 1 2
 $ test:List of 4
  ..$ : chr "5""7"
  ..$ : chr"6"
  ..$ : chr"9"
  ..$ : chr "8""10"
> out
    A B  test
1 111 1  5, 7
2 111 2     6
3 222 1     9
4 222 2 8, 10

在这种情况下,请注意,每个项目实际上仍然是单独的字符,而不是单个字符串。也就是说,这不是看起来像" 5,7 "的实际字符串,而是两个字符" 5 "和" 7 ",R用两个字符之间的逗号显示。

与以下各项进行比较:

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> out2 <- ddply(data, .(A, B), summarise, test = paste(C, collapse =","))
> str(out2)
'data.frame':   4 obs. of  3 variables:
 $ A   : num  111 111 222 222
 $ B   : int  1 2 1 2
 $ test: chr "5, 7""6""9""8, 10"
> out
    A B  test
1 111 1  5, 7
2 111 2     6
3 222 1     9
4 222 2 8, 10

基数R中的可比解当然是aggregate

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> A1 <- aggregate(C ~ A + B, data, function(x) c(as.character(x)))
> str(A1)
'data.frame':   4 obs. of  3 variables:
 $ A: num  111 222 111 222
 $ B: int  1 1 2 2
 $ C:List of 4
  ..$ 0: chr "5""7"
  ..$ 1: chr"9"
  ..$ 2: chr"6"
  ..$ 3: chr "8""10"
> A2 <- aggregate(C ~ A + B, data, paste, collapse =",")
> str(A2)
'data.frame':   4 obs. of  3 variables:
 $ A: num  111 222 111 222
 $ B: int  1 1 2 2
 $ C: chr "5, 7""9""6""8, 10"

这里有一个小的改进,可以避免重复

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# 1. Original data set
data <- data.frame(
  A = c(rep(111, 3), rep(222, 3)),
  B = rep(1:2, 3),
  C = c(5:10))

# 2. Add duplicate row
data <- rbind(data, data.table(
  A = 111, B = 1, C = 5
))

# 3. Solution with duplicates
data %>%
  group_by(A, B) %>%
  summarise(test = toString(C)) %>%
  ungroup()

#      A     B test  
#   <dbl> <dbl> <chr>  
# 1   111     1 5, 7, 5
# 2   111     2 6      
# 3   222     1 9      
# 4   222     2 8, 10

# 4. Solution without duplicates
data %>%
  select(A, B, C) %>% unique() %>%
  group_by(A, B) %>%
  summarise(test = toString(C)) %>%
  ungroup()

#    A     B test
#   <dbl> <dbl> <chr>
# 1   111     1 5, 7
# 2   111     2 6    
# 3   222     1 9    
# 4   222     2 8, 10

希望它会有用。